Основана станица Калниболотская в 1794 году казаками калниболотского куреня Запорожской Сечи, переселившимися на Кубань.
В истории станицы много памятных дат и событий, вписанных в летопись казаками. В 1814 году калниболотские казаки в составе русской армии вступили в Париж. В 1842 году Николай I утвердил «Положение о черноморском казачьем войске» и согласно ему поменялось название населенного пункта: вместо калниболотского куренного поселения — станица Калниболотская. В 1914 году местные казаки участвовали в Первой мировой войне на кавказском фронте. Трое стали полными георгиевскими кавалерами. 6 марта 1920 года в станице установилась советская власть, и атаман передал дела революционному комитету. Вплоть до 1991 года о казачестве пришлось забыть. С этого года воссоздали калниболотское куренное казачье общество, атаманом избрали Николая Романчука, который возглавляет его и по сей день.